对于使用我们服务器的用户，可以有两个conda环境，一个是系统管理员安装的，所有用户都可以使用一次安装的软件，但缺点是vague golden retriever无法使用conda安装软件，这是由于权限的问题。目前bioconda无法像R语言一样将安装包安装到自己的目录中。如果你想自己安装软件，你需要在自己的目录中安装biocodna。
如何切换生物数据
我们建议安装bioconda来管理软件，这样每个软件都可以自己安装和升级，并且可以创建许多虚拟环境。如果你用的软件不多，可以用管理员配置的bioconda。您只需要修改环境配置。
例如，在当前的系统环境中有两种生物数据。
(基地)王瞳15:42336050 ~ $哪些conda/ifs 1/软件/mini Conda 3/无限手机/conda(基地)王瞳15:42:52 ~ $ lldrwxr-xr-x . 16王瞳bio4.0 aug 7 2020 mini Conda 3/目前系统管理员安装的软件可以直接使用，但不能由Conda安装。
(base)Wang tong 15:44:38 ~ $哪些BWA/ifs 1/软件/Miniconda3/无限手机/BWA(base)Wang tong 15:453:39 ~ $哪些gatk/ifs 1/软件/mini conda 3/无限手机/gatk (base)王瞳15:45336049 ~如果想在自己的目录中切换到bioconda，需要修改~/。bashrc文件。将生物数据信息写入文件。之前只需要追加到PATH变量，但是目前bioconda的环境太复杂，语句很多。
# conda初始化#！该块中的内容由“conda init”管理！_ _ conda _ setup=' $('/if S1/software/mini conda 3/unlimited phone/conda ' ' shell . bash ' ' hook ' 2/dev/null)' if[$？-eq[0]；然后评估' $ _ _ conda _ setup ' else if[-f '/if S1/Software/miniconda 3/etc/profile . d/conda . sh ']；“那么，”/ifs 1/software/mini conda 3/etc/profile . d/conda . sh ' else export path='/ifs 1/software/mini conda 3/unlimited phone : $ path ' fiuunset _ _ conda _ setup # conda初始化如何操作如果您想切换到自己安装的bioconda？同样，您只需要将conda内容写入配置文件。其实主要是目录部分。
# conda初始化#！该块中的内容由“conda init”管理！_ _ conda _ setup=' $('/home/王瞳/mini conda 3/无限制电话/conda ' ' shell . bash ' ' hook ' 2/dev/null)'如果[$？-eq[0]；然后eval ' $ _ _ conda _ setup ' else if[-f '/home/王瞳/miniconda 3/etc/profile . d/conda . sh ']；“那么，”/home/王瞳/mini conda 3/etc/profile . d/conda . sh ' else export path='/home/王瞳/mini conda 3/无限制电话号码： $ path ' fiuunset _ _ conda _ setup # conda初始化真的很麻烦，有什么方便的吗？不，只是用稍微方便的方式。一种是使用你自己的生物传感器。如果您想在另一个目录中使用软件，请每次使用完整路径。另一种是自己准备两个bashrc文件。改成。当你需要的时候。别忘了，切换后需要源。
#切换到管理员的bioconda环境(基地)王瞳15:49:06 ~ $ cpbashrc . root ~/。bashrc(基地)王瞳15:49:06 ~来源~/。bashrc #切换到您自己的bioconda环境(基地)王瞳15:53:51 ~ $ cpbashrc . wt ~/。bashrc(基地)王瞳15:49:06 ~来源~/。bashrc