转录组分析揭示了参与调节EPSPS基因表达的转录因子，该基因赋予牛筋草对草甘膦的抗性
基于转录测序数据的紫茎泽兰EPSPS基因表达调控转录因子分析
本研究利用RNA-seq技术分析了与抗草甘膦泽兰EPS过表达相关的基因调控网络，筛选出相关转录因子。通过酵母单杂交技术在体外验证了相关转录因子与富含5’-UTR Py的伸展元件的结合。转录差异表达分析表明，与草甘膦敏感羊草相比，草甘膦处理后，2752个单基因表达增加，4025个单基因表达减少。其中，1373个单基因被鉴定为与EPSPS基因共表达。GO和KEGG途径分析表明，上调的单基因主要富集在叶绿体中，与莽草酸生物合成途径、叶绿素和过氧化物酶体代谢有关。值得注意的是，催化莽草酸转化为莽草酸3-磷酸酯的莽草酸激酶(S3P，底物S3P，EPSPS)的表达也上调。八个转录因子可能参与了EPSPS的表达，其中三个转录因子(ARF2、ARF8和BPC6)被预测能够与富含5’UTR Py的元件结合。酵母单杂交实验表明，ARF8和BPC6可与野生型5’-UTR富Py伸展元件结合，但不能再与其突变体结合。
本研究数据表明，与草甘膦敏感羊草相比，抗草甘膦羊草中EPSPS表达的转录调控机制发生了显著变化。
本研究首次筛选并分析了与EPPs基因表达调控相关的转录因子，可为基于EPPs过表达的细叶筋骨草抗草甘膦机制的进一步研究提供新的参考。
引用这篇文章
张春、于超杰、张泰杰、郭文磊、田兴山。2021.转录组分析揭示了参与调节EPSPS基因表达的转录因子，该基因赋予牛筋草对草甘膦的抗性。综合农业杂志，20(8): 21802194。