lefse分析发现,lefse菌群分析到种水平吗

lefse(LDAeffectsize )分析可用于两个或多个组之间的比较，从而找到组之间存在显著差异的物种(即biomarker )。 分析步骤主要分为三个步骤。

步骤1 :采用kruskal-Wallis秩和检验检测所有特征种，通过检测不同群体间物种丰度的差异，获得显著差异种。

Step2)重用Wilcoxon秩，验证上一步获得的显著差异种亚种是否均在同一分类级别。

Step3)最后进行线性判别分析(LDA )，得到最终的差异种(即biomarker )。