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origin柱状图显著性差异标注,graphpad显著性分析

时间:2023-05-06 11:33:07 阅读:171581 作者:326

按照Cell学作图| 2.柱状图误差棒散布“实践是检验真理的唯一标准”

“再现是学习r语言的最好方法。 ”

2021.4.12 _1doi :10.1016/j.cell.2020.05.032

这篇2020年在cell发表的关于新冠的组织学报道中,包含了大量的生活信息的内容。 今天是其中的一个supplemental figure:http://www.Sina.com /

接收正文代码和示例数据:“带散点的柱状图

2021.4.14_1这张图怎么说都很普通。 但是,再现过程中有值得学习的东西。

数据格式表1用于散点图制作

表2是用于制作柱状图的表。 (合计表1 ) ) ) ) ) ) ) ) ) ) )。

2021.4.14_3注:上述数据纯属虚构,无实际意义。

思路柱状图显著性检验误差棒散点

----title : ' bar plot ' author : ' mzbj ' date : ' 2020/4/14 '-- #导入所需的软件包library(ggplot2) library 导入数据plot _ data1-read.CSV (file=' NPT _ SOD.CSV ' ) plot _ data2- read.CSV (file=' NPT.CSV ' ) - #数据格式width=0.6 )条形图大小geom_jitter(data=plot_data2,#散点图=AES (x=group,y=Retive_Abundance ) fill=#散点纵向振摆width=0.1 )散点横向振摆scale _ color _ manual (values=c (# 1e 90ff (,gold ), red ) )散点色geom_signif ) )散点y=Retive_Abundance (,#不同组显著性comparisons=list(c )、(n )、(p ) ) )哪一组c 0 )、#改性线两端的长度y_position=c ) 46、54、49 )、#改性线的位置高度size=1、#改性线的粗细#修正*标记的尺寸test='t.test ' ) #检查的塔塔ymin=mean-sd,ymin-SD 'gold ',' red ',#颜色size=0.8 )粗细scale _ y _ continuous (limits=c (0,60 ),Expand=c ) 0 ) ) y轴的范围thement这是无线条主题base_line_size=1#坐标轴的粗细(labs(title='whitebloodcell(WBC ),x=',y=' )

itle = element_text(size = 15,                                  colour = "black",                                  hjust = 0.5),        axis.title.y = element_text(size = 15,                                     # family = "myFont",                                     color = "black",                                    face = "bold",                                     vjust = 1.9,                                     hjust = 0.5,                                     angle = 90),        legend.title = element_text(color="black", # 修改图例的标题                                    size=15,                                     face="bold"),        legend.text = element_text(color="black", # 设置图例标签文字                                   size = 10,                                    face = "bold"),        axis.text.x = element_text(size = 13,  # 修改X轴上字体大小,                                   color = "black", # 颜色                                   face = "bold", #  face取值:plain普通,bold加粗,italic斜体,bold.italic斜体加粗                                   vjust = 0.5, # 位置                                   hjust = 0.5,                                    angle = 0), #角度        axis.text.y = element_text(size = 13,                                     color = "black",                                   face = "bold",                                    vjust = 0.5,                                    hjust = 0.5,                                    angle = 0)   ) p

2021.4.14_4

大功告成!

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跟着CELL学作图|1.火山图

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