欢迎关注”生信修炼手册”!
UCSC Xena是一个癌症基因组学数据分析平台，支持对癌症样本的多种组学数据进行可视化和分析,网址如下
https://xenabrowser.net/
该平台内置了一些公共数据集，比如来自TCGA, ICGC等大型癌症研究项目的数据，不仅可以对数据进行分析，而且还提供了对应文件的下载功能。同时还支持对自己的数据进行分析，而且保证了数据的安全性，不用担心上传之后被别的用户窃取到。
支持下列多种类型数据的展示
snv/indel
SV
CNV
gene/transcript/protein expression
DNA methylation
ATAC-seq signals
phenotypic/clinical/sample annotations
内置数据集的下载链接如下
https://xenabrowser.net/datapages/
包含了下图所示的多种来源的数据集
而且这里的数据是整理之后的，TCGA部分数据截图如下
以TCGA Lung Cancer为例，点击之后可以看到详细的数据集，示意如下
以IlluminaHiSeq数据集为例，点击对应的链接可以看到该数据集的下载链接以及数据的一个概述，示意如下
对于TCGA等公共数据集而言，从该平台下载也非常的方便，直接下载的就是整理好之后的结果，方便后续分析。
通过该平台，可以方便的展示多组学的数据，示意如下
也可以进行生存分析，结果如下所示
官网也提供了详细的帮助文档和对应的示例，更多用法请参阅官方文档。
·end·
—如果喜欢，快分享给你的朋友们吧—
扫描关注微信号，更多精彩内容等着你！