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kegg富集分析气泡图结果解读,kegg富集分析结果解读

时间:2023-05-05 07:46:30 阅读:20186 作者:29

在上一次转录组可视化课上,一位老师看到丰富分析气泡图的图例Count中存在小数,就提出了为什么基因数量有小数的问题。

到目前为止,我们还没有注意到这个问题,应该是因为ggplot2的缺省图例生成方法。

查看下面的代码时,数据会生成相同长度的区间,可以得到小数,也可以得到整数。

seq (10,20,length=5) [1]10.012.515.017.520.0seq ) 10,14,length=5) [1] 10 11 12 13 14,出现在图例中其本身的意义在于这样大的点表示的基因数有多少,一般也不要求必须是整数。 但为了避免误会,这个问题还是必须解决。

如果根据显示的图例间隔数人工计算步骤,生成整个图例的数字,则全部为整数。 在前一个绘制代码中添加下一个代码就可以了。

min=min(data[[size_variable]] ) max=max ) data [ [ size _ variable ] ]4islengthstep=ceiling ) ) max-mi

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