我建议题主学习R语言。为什么这么说呢? 因为题主是临床医学领域。
本人工科生，在研究生期间主要做医学数据分析，导师刚好和医院临川方面有些合作，稍微有点感受。同时，前期也是以R语言为主，后期为了找工作学的Python，没办法企业还是Python更加流行。
首先，一方面，医学工作者主要以发论文为主，R语言的认可度比Python高很多，大部分文章的数据分析基本都是SPSS，SAS，R语言为主，Python很少；另一方面，R语言在统计学上的认可度非常高，大部分统计模型，结果的准确性以及展示都非常好，同时在很多前沿的医学，生物医学领域，R语言都有对应的library。
其次，针对题主的两个问题，数据收集，在医院基本都有对应的系统。为了分析，基本都是要导出，整理，R语言有很多非常完善的数据处理library。可视化方面，R语言ggplot2非常强大，而且对应的包在生物信息可视化，比如生信分析，基因检测方面都有非常好的可视化效果，很多论文里面的图非常好看。
最后，说一次Python，Python确实在数据挖掘也确实非常强大，特别是机器学习这一块，但其功能更加强大，不仅仅是数据分析，还有web开发，爬虫等。老实说，其实现在大部分模型在R和Python里面也基本都有相应的库。如果题主遇到只有Python有的库，也可以查一下Python，毕竟现在R和Python的互调也不是很麻烦。
综上，首推R语言，学有余力可以看看Python。