TCGA数据下载有很多方式，比如说使用生信人小工具下载，比如说使用R语言下载等等，但是在这里我想说的如何使用TCGA官网下载数据。（在官网下载数据的一大优势在哪里呢？这里我不做过多的解释）
首先，先进入TCGA官网 https://portal.gdc.cancer.gov/
首先下载在官网下载所需要的小工具
根据自己的电脑选择合适的版本，返回上一层，进入Repository，打开后类似于这样的界面
左边就是需要选择的类型
如，我们需要下载mRNA的表达谱数据，HTSeq-Counts是最原始的reads，后期需要进行标准化和归一化处理的
在这里选择肿瘤类型
这里以乳腺癌为例
后面的根据需求自行选择，右边就会出现很多样本
下载三个文件
打开cmd命令行界面
便可以下载成功了，成功后会出现肿瘤样本和正常样本的个数，需要记录下来，整理数据使用的是perl可以先安装perl