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聚类异常检测代码python(聚类分析程序代码)

时间:2023-12-06 11:46:57 阅读:312515 作者:SSZI

本文目录一览:

  • 1、python异常值处理
  • 2、对于异常值的检测
  • 3、如何用python对文本进行聚类
  • 4、python(unsubscriptable object异常)
  • 5、python代码如何应用系统聚类和K-means聚类法进行聚类分析? 然后选择变量,建立适当的模型?
  • 6、建议收藏!10 种 Python 聚类算法完整操作示例

python异常值处理

如果你用 Python 编程,那么你就无法避开异常,因为异常在这门语言里无处不在。打个比方,当你在脚本执行时按 ctrl+c 退出,解释器就会产生一个 KeyboardInterrupt 异常。而 KeyError、ValueError、TypeError 等更是日常编程里随处可见的老朋友。

异常处理工作由“捕获”和“抛出”两部分组成。“捕获”指的是使用 try ... except 包裹特定语句,妥当的完成错误流程处理。而恰当的使用 raise 主动“抛出”异常,更是优雅代码里必不可少的组成部分。

异常分类

BaseException 所有异常的基类

Exception 常见错误的基类

ArithmeticError 所有数值计算错误的基类

Warning 警告的基类

AssertError 断言语句(assert)失败

AttributeError 尝试访问未知的对象属性

DeprecattionWarning 关于被弃用的特征的警告

EOFError 用户输入文件末尾标志EOF(Ctrl+d)

FloattingPointError 浮点计算错误

FutureWarning 关于构造将来语义会有改变的警告

GeneratorExit generator.close()方法被调用的时候

ImportError 导入模块失败的时候

IndexError 索引超出序列的范围

KeyError 字典中查找一个不存在的关键字

KeyboardInterrupt 用户输入中断键(Ctrl+c)

MemoryError 内存溢出(可通过删除对象释放内存)

NamerError 尝试访问一个不存在的变量

NotImplementedError 尚未实现的方法

OSError 操作系统产生的异常(例如打开一个不存在的文件)

OverflowError 数值运算超出最大限制

OverflowWarning 旧的关于自动提升为长整型(long)的警告

PendingDeprecationWarning 关于特征会被遗弃的警告

ReferenceError 弱引用(weak reference)试图访问一个已经被垃圾回收机制回收了的对象

RuntimeError 一般的运行时错误

RuntimeWarning 可疑的运行行为(runtime behavior)的警告

StopIteration 迭代器没有更多的值

SyntaxError Python的语法错误

SyntaxWarning 可疑的语法的警告

IndentationError 缩进错误

TabError Tab和空格混合使用

SystemError Python编译器系统错误

SystemExit Python编译器进程被关闭

TypeError 不同类型间的无效操作

UnboundLocalError 访问一个未初始化的本地变量(NameError的子类)

UnicodeError Unicode相关的错误(ValueError的子类)

UnicodeEncodeError Unicode编码时的错误(UnicodeError的子类)

UnicodeDecodeError Unicode解码时的错误(UnicodeError的子类)

UserWarning 用户代码生成的警告

ValueError 传入无效的参数

ZeroDivisionError 除数为零

对于异常值的检测

离群点,是一个数据对象,它显著不同于其他数据对象,与其他数据分布有较为显著的不同。有时也称非离群点为“正常数据”,离群点为“异常数据”。

离群点跟噪声数据不一样,噪声是被观测变量的随机误差或方差。一般而言,噪声在数据分析(包括离群点分析)中不是令人感兴趣的,需要在数据预处理中剔除的,减少对后续模型预估的影响,增加精度。

离群点检测是有意义的,因为怀疑产生它们的分布不同于产生其他数据的分布。因此,在离群点检测时,重要的是搞清楚是哪种外力产生的离群点。

常见的异常成因:

通常,在其余数据上做各种假设,并且证明检测到的离群点显著违反了这些假设。如统计学中的假设检验,基于小概率原理,对原假设进行判断。一般检测离群点,是人工进行筛选,剔除不可信的数据,例如对于房屋数据,面积上万,卧室数量过百等情况。而在面对大量的数据时,人工方法耗时耗力,因此,才有如下的方法进行离群点检测。

统计学方法是基于模型的方法,即为数据创建一个模型,并且根据对象拟合模型的情况来评估它们。大部分用于离群点检测的统计学方法都是构建一个概率分布模型,并考虑对象有多大可能符合该模型。

离群点的概率定义:离群点是一个对象,关于数据的概率分布模型,它具有低概率。这种情况的前提是必须知道数据集服从什么分布,如果估计错误就造成了重尾分布。

a. 参数法:

当数据服从正太分布的假设时在正态分布的假定下,u±3σ区域包含99.7%的数据,u±2σ包含95.4%的数据,u±1σ包含68.3%的数据。其区域外的数据视为离群点。

当数据是非正态分布时,可以使用切比雪夫不等式,它对任何分布形状的数据都适用。根据 切比雪夫不等式 ,至少有(1-1/k 2 )的数据落在±k个标准差之内。所以,有以下结论:

计算得到:通过绘制箱线图可以直观地找到离群点,或者通过计算四分位数极差(IQR)定义为Q3-Q1。比Q1小1.5倍的IQR或者比Q3大1.5倍的IQR的任何对象都视为离群点,因为Q1-1.5IQR和Q3+1.5IQR之间的区域包含了99.3%的对象。

涉及两个或多个属性或变量的数据称为多元数据。核心思想是把多元离群点检测任务转换成一元离群点检测问题。

- 卡方统计量的多元离群点检测 :正态分布的假定下,卡方统计量也可以用来捕获多元离群点,对象 ,卡方统计量是: , 是 在第i维上的值, 是所有对象在第i维上的均值,而n是维度。如果对象的卡方统计量很大,则该对象是离群点。

b. 非参数法:

构造直方图

为了构造一个好的直方图,用户必须指定直方图的类型和其他参数(箱数、等宽or等深)。最简单的方法是,如果该对象落入直方图的一个箱中,则该对象被看做正常的,否则被认为是离群点。也可以使用直方图赋予每个对象一个离群点得分,比如对象的离群点得分为该对象落入的箱的容积的倒数。但这个方法很难选择一个较好的直方图参数。

注意 :

传统的观点都认为孤立点是一个单独的点,然而很多的现实情况是异常事件具有一定的时间和空间的局部性,这种局部性会产生一个小的簇.这时候离群点(孤立点)实际上是一个小簇(图下图的C1和C3)。

一个对象是异常的,如果它远离大部分点。这种方法比统计学方法更一般、更容易使用,因为确定数据集的有意义的邻近性度量比确定它的统计分布更容易。不依赖统计检验,将基于邻近度的离群点看作是那些没有“足够多“邻居的对象。这里的邻居是用 邻近度(距离) 来定义的。最常用的距离是绝对距离(曼哈顿)和欧氏距离等等。

一个对象的离群点得分由到它的k-最近邻的距离给定。离群点得分对k的取值高度敏感。如果k太小,则少量的邻近离群点可能导致离群点较少;如果K太大,则点数少于k的簇中所有的对象可能都成了离群点,导致离群点过多。为了使该方案对于k的选取更具有鲁棒性,可以使用k个最近邻的平均距离。

从基于密度的观点来说,离群点是在低密度区域中的对象。一个对象的离群点得分是该对象周围密度的逆。基于密度的离群点检测与基于邻近度的离群点检测密切相关,因为密度通常用邻近度定义。

定义密度

一种常用的定义密度的方法是,定义密度为到k个最近邻的平均距离的倒数 。如果该距离小,则密度高,反之亦然。

另一种密度定义是使用DBSCAN聚类算法使用的密度定义,即一个对象周围的密度等于该对象指定距离d内对象的个数。 需要小心的选择d,如果d太小,则许多正常点可能具有低密度,从而离群点较多。如果d太大,则许多离群点可能具有与正常点类似的密度(和离群点得分)无法区分。 使用任何密度定义检测离群点具有与基于邻近度的离群点方案类似的特点和局限性。特殊地,当数据包含不同密度的区域时,它们不能正确的识别离群点。

定义相对密度

为了正确的识别这种数据集中的离群点,我们需要与对象邻域相关的密度概念,也就是定义相对密度。常见的有两种方法:

(1)使用基于SNN密度的聚类算法使用的方法;

(2)用点x的密度与它的最近邻y的平均密度之比作为相对密度。使用相对密度的离群点检测( 局部离群点要素LOF技术 ):

一种利用聚类检测离群点的方法是丢弃远离其他簇的小簇。这个方法可以和其他任何聚类技术一起使用,但是需要最小簇大小和小簇与其他簇之间距离的阈值。这种方案对簇个数的选择高度敏感。使用这个方案很难将离群点得分附加到对象上。

一种更系统的方法,首先聚类所有的点,对某个待测点评估它属于某一簇的程度。(基于原型的聚类可用离中心点的距离来评估,对具有目标函数(例如kmeans法时的簇的误差平方和)的聚类技术,该得分反映删除对象后目标函数的改进),如果删去此点能显著地改善此项目标函数,则可以将该点定位为孤立点。

基于聚类的离群点:一个对象是基于聚类的离群点,如果该对象不强属于任何簇。离群点对初始聚类的影响:如果通过聚类检测离群点,则由于离群点影响聚类,存在一个问题:结构是否有效。为了处理该问题,可以使用如下方法:

对象是否被认为是离群点可能依赖于簇的个数(如k很大时的噪声簇)。该问题也没有简单的答案。一种策略是对于不同的簇个数重复该分析。另一种方法是找出大量小簇,其想法是(1)较小的簇倾向于更加凝聚,(2)如果存在大量小簇时一个对象是离群点,则它多半是一个真正的离群点。不利的一面是一组离群点可能形成小簇而逃避检测。

根据已有训练集检测新样本是否异常

异常检测根据原始数据集的不同可分为两类:

novelty detection: 训练集中没有异常样本

outlier detection: 训练集中有异常样本

异常样本:

数量少,比较分散

novelty detection和outlier detection的区别:

Sklearn异常检测模型一览

5.1 奇异点检测(Novelty Detection)

奇异点检测,就是判断待测样本到底是不是在原来数据的概率分布内。概率学上认为,所有的数据都有它的隐藏的分布模式,这种分布模式可以由概率模型来具象化。

5.1 离群点检测(Outlier Detection)

不同与奇异点检测是,现在我们没有一个干净的训练集(训练集中也有噪声样本)。下面介绍的三种离群点检测算法其实也都可以用于奇异点检测。

如果我们认为,可达密度小的目标样本点就是异常点,这样未尝不可。但是,LOF算法更进一步。

LOF可以用来判断经纬度的异常。

使用python进行异常值(outlier)检测实战:KMeans + PCA + IsolationForest + SVM + EllipticEnvelope

文章引用: 数据挖掘:数据清洗——异常值处理

如何用python对文本进行聚类

实现原理:

首先从Tourist_spots_5A_BD.txt中读取景点信息,然后通过调用无界面浏览器PhantomJS(Firefox可替代)访问百度百科链接"",通过Selenium获取输入对话框ID,输入关键词如"故宫",再访问该百科页面。最后通过分析DOM树结构获取摘要的ID并获取其值。核心代码如下:

driver.find_elements_by_xpath("//div[@class='lemma-summary']/div")

PS:Selenium更多应用于自动化测试,推荐Python爬虫使用scrapy等开源工具。

# coding=utf-8

"""

Created on 2015-09-04 @author: Eastmount

"""

import time

import re

import os

import sys

import codecs

import shutil

from selenium import webdriver

from selenium.webdriver.common.keys import Keys

import selenium.webdriver.support.ui as ui

from selenium.webdriver.common.action_chains import ActionChains

#Open PhantomJS

driver = webdriver.PhantomJS(executable_path="G:phantomjs-1.9.1-windowsphantomjs.exe")

#driver = webdriver.Firefox()

wait = ui.WebDriverWait(driver,10)

#Get the Content of 5A tourist spots

def getInfobox(entityName, fileName):

try:

#create paths and txt files

print u'文件名称: ', fileName

info = codecs.open(fileName, 'w', 'utf-8')

#locate input notice: 1.visit url by unicode 2.write files

#Error: Message: Element not found in the cache -

# Perhaps the page has changed since it was looked up

#解决方法: 使用Selenium和Phantomjs

print u'实体名称: ', entityName.rstrip('n')

driver.get("")

elem_inp = driver.find_element_by_xpath("//form[@id='searchForm']/input")

elem_inp.send_keys(entityName)

elem_inp.send_keys(Keys.RETURN)

info.write(entityName.rstrip('n')+'rn') #codecs不支持'n'换行

time.sleep(2)

#load content 摘要

elem_value = driver.find_elements_by_xpath("//div[@class='lemma-summary']/div")

for value in elem_value:

print value.text

info.writelines(value.text + 'rn')

time.sleep(2)

except Exception,e: #'utf8' codec can't decode byte

print "Error: ",e

finally:

print 'n'

info.close()

#Main function

def main():

#By function get information

path = "BaiduSpider\"

if os.path.isdir(path):

shutil.rmtree(path, True)

os.makedirs(path)

source = open("Tourist_spots_5A_BD.txt", 'r')

num = 1

for entityName in source:

entityName = unicode(entityName, "utf-8")

if u'故宫' in entityName: #else add a '?'

entityName = u'北京故宫'

name = "%04d" % num

fileName = path + str(name) + ".txt"

getInfobox(entityName, fileName)

num = num + 1

print 'End Read Files!'

source.close()

driver.close()

if __name__ == '__main__':

main()

python(unsubscriptable object异常)

python(unsubscriptable object异常),是设置错误造成的,解决方法如下;

1、首先创建一个py文件,输入“for i in range(10):y=1if i==5:y=0i=i/yprint(i)”代码,如下图所示。

2、运行py文件,可以看到程序运行到i等于5的时候出现了分母为0的异常,程序中断不继续执行,如下图所示。

3、这时将可能出现异常的代码添加try...except...语句,代码如下图。

4、运行py文件,可以看到python已经跳过异常继续执行了,如下图所示。

5、如果是函数调用可能出现异常的话,可以在函数外面使用try...except...语句,这样程序出现异常了,可以继续执行。

python代码如何应用系统聚类和K-means聚类法进行聚类分析? 然后选择变量,建立适当的模型?

-Means聚类算法

k-means算法以k为参数,把n个对象分成k个簇,使簇内具有较高的相似度,而簇间的相似度较低。

随机选择k个点作为初始的聚类中心。

对于剩下的点,根据其与聚类中心的距离,将其归入最近的簇。

对每个簇,计算所有点的均值作为新的聚类中心。

重复2,3直到聚类中心不再发生改变

Figure 1

K-means的应用

数据介绍:

现有1999年全国31个省份城镇居民家庭平均每人全年消费性支出的八大主要变量数据,这八大变量分别是:食品、衣着、家庭设备用品及服务、医疗保健、交通和通讯、娱乐教育文化服务、居住以及杂项商品和服务。利用已有数据,对31个省份进行聚类。

实验目的:

通过聚类,了解1999年各个省份的消费水平在国内的情况。

技术路线:

sklearn.cluster.Kmeans

数据实例:

建议收藏!10 种 Python 聚类算法完整操作示例

聚类或聚类分析是无监督学习问题。它通常被用作数据分析技术,用于发现数据中的有趣模式,例如基于其行为的客户群。有许多聚类算法可供选择,对于所有情况,没有单一的最佳聚类算法。相反,最好探索一系列聚类算法以及每种算法的不同配置。在本教程中,你将发现如何在 python 中安装和使用顶级聚类算法。完成本教程后,你将知道:

聚类分析,即聚类,是一项无监督的机器学习任务。它包括自动发现数据中的自然分组。与监督学习(类似预测建模)不同,聚类算法只解释输入数据,并在特征空间中找到自然组或群集。

群集通常是特征空间中的密度区域,其中来自域的示例(观测或数据行)比其他群集更接近群集。群集可以具有作为样本或点特征空间的中心(质心),并且可以具有边界或范围。

聚类可以作为数据分析活动提供帮助,以便了解更多关于问题域的信息,即所谓的模式发现或知识发现。例如:

聚类还可用作特征工程的类型,其中现有的和新的示例可被映射并标记为属于数据中所标识的群集之一。虽然确实存在许多特定于群集的定量措施,但是对所识别的群集的评估是主观的,并且可能需要领域专家。通常,聚类算法在人工合成数据集上与预先定义的群集进行学术比较,预计算法会发现这些群集。

有许多类型的聚类算法。许多算法在特征空间中的示例之间使用相似度或距离度量,以发现密集的观测区域。因此,在使用聚类算法之前,扩展数据通常是良好的实践。

一些聚类算法要求您指定或猜测数据中要发现的群集的数量,而另一些算法要求指定观测之间的最小距离,其中示例可以被视为“关闭”或“连接”。因此,聚类分析是一个迭代过程,在该过程中,对所识别的群集的主观评估被反馈回算法配置的改变中,直到达到期望的或适当的结果。scikit-learn 库提供了一套不同的聚类算法供选择。下面列出了10种比较流行的算法:

每个算法都提供了一种不同的方法来应对数据中发现自然组的挑战。没有最好的聚类算法,也没有简单的方法来找到最好的算法为您的数据没有使用控制实验。在本教程中,我们将回顾如何使用来自 scikit-learn 库的这10个流行的聚类算法中的每一个。这些示例将为您复制粘贴示例并在自己的数据上测试方法提供基础。我们不会深入研究算法如何工作的理论,也不会直接比较它们。让我们深入研究一下。

在本节中,我们将回顾如何在 scikit-learn 中使用10个流行的聚类算法。这包括一个拟合模型的例子和可视化结果的例子。这些示例用于将粘贴复制到您自己的项目中,并将方法应用于您自己的数据。

1.库安装

首先,让我们安装库。不要跳过此步骤,因为你需要确保安装了最新版本。你可以使用 pip Python 安装程序安装 scikit-learn 存储库,如下所示:

接下来,让我们确认已经安装了库,并且您正在使用一个现代版本。运行以下脚本以输出库版本号。

运行该示例时,您应该看到以下版本号或更高版本。

2.聚类数据集

我们将使用 make _ classification ()函数创建一个测试二分类数据集。数据集将有1000个示例,每个类有两个输入要素和一个群集。这些群集在两个维度上是可见的,因此我们可以用散点图绘制数据,并通过指定的群集对图中的点进行颜色绘制。这将有助于了解,至少在测试问题上,群集的识别能力如何。该测试问题中的群集基于多变量高斯,并非所有聚类算法都能有效地识别这些类型的群集。因此,本教程中的结果不应用作比较一般方法的基础。下面列出了创建和汇总合成聚类数据集的示例。

运行该示例将创建合成的聚类数据集,然后创建输入数据的散点图,其中点由类标签(理想化的群集)着色。我们可以清楚地看到两个不同的数据组在两个维度,并希望一个自动的聚类算法可以检测这些分组。

已知聚类着色点的合成聚类数据集的散点图接下来,我们可以开始查看应用于此数据集的聚类算法的示例。我已经做了一些最小的尝试来调整每个方法到数据集。3.亲和力传播亲和力传播包括找到一组最能概括数据的范例。

它是通过 AffinityPropagation 类实现的,要调整的主要配置是将“ 阻尼 ”设置为0.5到1,甚至可能是“首选项”。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,我无法取得良好的结果。

数据集的散点图,具有使用亲和力传播识别的聚类

4.聚合聚类

聚合聚类涉及合并示例,直到达到所需的群集数量为止。它是层次聚类方法的更广泛类的一部分,通过 AgglomerationClustering 类实现的,主要配置是“ n _ clusters ”集,这是对数据中的群集数量的估计,例如2。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,可以找到一个合理的分组。

使用聚集聚类识别出具有聚类的数据集的散点图

5.BIRCHBIRCH

聚类( BIRCH 是平衡迭代减少的缩写,聚类使用层次结构)包括构造一个树状结构,从中提取聚类质心。

它是通过 Birch 类实现的,主要配置是“ threshold ”和“ n _ clusters ”超参数,后者提供了群集数量的估计。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,可以找到一个很好的分组。

使用BIRCH聚类确定具有聚类的数据集的散点图

6.DBSCANDBSCAN

聚类(其中 DBSCAN 是基于密度的空间聚类的噪声应用程序)涉及在域中寻找高密度区域,并将其周围的特征空间区域扩展为群集。

它是通过 DBSCAN 类实现的,主要配置是“ eps ”和“ min _ samples ”超参数。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,尽管需要更多的调整,但是找到了合理的分组。

使用DBSCAN集群识别出具有集群的数据集的散点图

7.K均值

K-均值聚类可以是最常见的聚类算法,并涉及向群集分配示例,以尽量减少每个群集内的方差。

它是通过 K-均值类实现的,要优化的主要配置是“ n _ clusters ”超参数设置为数据中估计的群集数量。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,可以找到一个合理的分组,尽管每个维度中的不等等方差使得该方法不太适合该数据集。

使用K均值聚类识别出具有聚类的数据集的散点图

8.Mini-Batch

K-均值Mini-Batch K-均值是 K-均值的修改版本,它使用小批量的样本而不是整个数据集对群集质心进行更新,这可以使大数据集的更新速度更快,并且可能对统计噪声更健壮。

它是通过 MiniBatchKMeans 类实现的,要优化的主配置是“ n _ clusters ”超参数,设置为数据中估计的群集数量。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,会找到与标准 K-均值算法相当的结果。

带有最小批次K均值聚类的聚类数据集的散点图

9.均值漂移聚类

均值漂移聚类涉及到根据特征空间中的实例密度来寻找和调整质心。

它是通过 MeanShift 类实现的,主要配置是“带宽”超参数。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,可以在数据中找到一组合理的群集。

具有均值漂移聚类的聚类数据集散点图

10.OPTICSOPTICS

聚类( OPTICS 短于订购点数以标识聚类结构)是上述 DBSCAN 的修改版本。

它是通过 OPTICS 类实现的,主要配置是“ eps ”和“ min _ samples ”超参数。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,我无法在此数据集上获得合理的结果。

使用OPTICS聚类确定具有聚类的数据集的散点图

11.光谱聚类

光谱聚类是一类通用的聚类方法,取自线性线性代数。

它是通过 Spectral 聚类类实现的,而主要的 Spectral 聚类是一个由聚类方法组成的通用类,取自线性线性代数。要优化的是“ n _ clusters ”超参数,用于指定数据中的估计群集数量。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,找到了合理的集群。

使用光谱聚类聚类识别出具有聚类的数据集的散点图

12.高斯混合模型

高斯混合模型总结了一个多变量概率密度函数,顾名思义就是混合了高斯概率分布。它是通过 Gaussian Mixture 类实现的,要优化的主要配置是“ n _ clusters ”超参数,用于指定数据中估计的群集数量。下面列出了完整的示例。

运行该示例符合训练数据集上的模型,并预测数据集中每个示例的群集。然后创建一个散点图,并由其指定的群集着色。在这种情况下,我们可以看到群集被完美地识别。这并不奇怪,因为数据集是作为 Gaussian 的混合生成的。

使用高斯混合聚类识别出具有聚类的数据集的散点图

在本文中,你发现了如何在 python 中安装和使用顶级聚类算法。具体来说,你学到了:

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