南京地铁实行通票，站内换乘免费，在乘车站买票的时候直接买到目的地站。
在售票机上买票，需要知道目的地出站站名，先点击目的地站所属线路，找到后再点击站名一下，会跳出一张票的价格，默认买一张，下面可以选择一次买多张。南京地铁售票机只接受十元、五元的纸币或者一元硬币，会找零，没有零钱可以去客服那儿兑换。
还有一种简单的买票方法就是屏幕右侧快捷买票那儿点一下2元，买一张最便宜的票，先刷票进站，到目的地站如果票投不进去出不了站，直接找旁边客服补票出站。
直接到人工窗口，告诉客服目的地购买纸质车票。
(4)南京南站支付宝买地铁扩展阅读：
地铁南京南站，于2011年6月28日开通，是南京地铁制1号线、南京地铁3号线、南京地铁S1号线、南京地铁S3号线和南京地铁6号线的换乘车站，也是南京地铁最大的换乘枢纽。
南京地铁1号线：迈皋桥（5:42-23:20）到中国药科大学（5:47-23:27） 票价：2-6元（IC卡通用），换乘站点：南京站（3号线）、新街口（2号线）、安德门（10号线）、南京南站（3号线、S1号线）。
南京地铁3号线：林场（06:00-23:00）到江宁秣周东路（06:00-23:00 ）票价：2-7元（IC卡通用），换乘站点：泰冯路（S8号线）、南京站（1号线）、大行宫（2号线）、南京南站（1号线、S1号线）。
南京地铁S1机场线：南京南站（6:00-22:00）到禄口机场（6:40-22:00 ）票价：2-6元（IC卡通用）。