项目将分三期建设实施：
一期工程，R2线一期，石龙站-新城中心;首条地铁线的R2线，将于2015年开通。
东莞地铁规划
二期工程，R2线二期，新城中心-长安汽车站;
三期工程，包括R1线一期和R3线一期。
一期工程
R2线从石龙火车站西广场到长安镇振安一路，是一条由北部-西南方向的切线，全长59.9 1公里，其中学院路北站至省道S256段及虎门商贸城段为地下线，长16.2 2公里，其余为高架线，长43.69公里，途经石碣、石龙、茶山、东城、莞城、南城、厚街、和长安9个镇区，设站20个。地铁R2线首段(东莞火车站-虎门火车站)于2010年3月份已全面动工，线路总长37.743Km，其中地下线长33.730km，占线路总长的89.37%，高架线长3.589km，占线路总长的9.51%，过渡段长0.424km，占线路总长的1.12%。全线共设车站15座(东莞火车站、茶山、榴花公园、下桥、天宝、东城、旗峰公园、鸿福路、西平、蛤地、陈屋、寮厦、珊美、展览中心、虎门火车站【白沙】)其中地下站14个，高架站1个，而天宝站-东城站区间试验段隧道于2011年6月30日正式挖掘，计划于12月打通。按照计划R2线首段2015年投入运营，届时东莞市民可乘坐地铁出行。