南京地铁是国企。
南京地下铁道有限责任公司简称南京地铁总公司，官方称谓为南京地铁指挥部，是南京（市委）市政府直属的一个正局级行政机构（机关）。其主管南京市境内所有市属轨道交通的建设、运营以及相关产业实业开发。
南京地铁运营分公司是南京地铁总公司的下（直）属单位，由南京地铁总公司全额出资（南京地铁总公司的资金来源为省市两级的财政拨款），采取模拟法人、独立“经营”、全额（财政）拨款的国有公益性单位。分管南京市境轨道交通的运营，保证其运营安全，确保国有资产的保值增值。
(1)南京地铁总公司扩展阅读：
南京地铁是服务于南京市及南京都市圈各地区的城市轨道交通，前身可以追溯到1907年（清光绪三十三年）建造的京市铁路，其首条线路于2005年5月15日正式通车，使南京成为中国大陆第6个开通地铁的城市。
截至2018年5月，南京地铁已开通运营线路共有10条，包括1、2、3、4、10、S1、S3、S7、S8及S9号线，共174座车站，地铁线路总长378千米；
线路总长居中国第4（仅次于上海、北京、广州）、世界第5位，构成覆盖南京全市11个市辖区的地铁网络，南京成为中国第一个区县全部开通地铁的城市。
参考资料来源：网络-南京地下铁道有限责任公司