规划中将有8条轨道线(M1、M6、M6支、S6、R1、R1支、S3、S5)覆盖通州新城，轨道交通线网的密度甚至超过了中心城的很多地区。其中地铁6号线二期即将启动。
市规划委等部门正在研究一条新的地铁线路，它将铺设在地铁1号线的下部，向东通往通州新城目前的核心区。“如果这条线路最终确定规划，将会采用大站快车的方式，站点较少，速度很快，能快速连接中心城和通州新城。”
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