南京火车站和高铁站不在一起。
南京站（南京火车站）位于江苏省南京市玄武区，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客运一等站，是南京铁路枢纽的重要组成部分。南京站前临玄武湖，后枕小红山，是中国唯一临湖依山的火车站，被誉为“中国最美火车站”。
南京南站（南京高铁站）位于江苏省南京市雨花台区，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的客运站，是南京铁路枢纽的重要组成部分，也华东地区最大的交通枢纽，国家铁道枢纽站，是亚洲第一大火车站和亚洲第一大高铁站。
(2)但南京站的地铁扩展阅读：
1、南京火车站站台线路：
截至2018年底，南京站共有站台16座，到发线14条，其中普速场8条，城际场6条。南京站南侧的10条股道供普速列车使用，北侧的6条股道供沪宁城际铁路列车使用，主要途经线路有京沪铁路、宁芜铁路、宁西铁路、宁启铁路、沪宁城际铁路、宁蚌城际铁路、宁扬城际铁路、宁宣黄高速铁路。
2、南京南站布局和线路：
南京南站地面层为换乘广场，广场中心区域有南京地铁1号线、南京地铁3号线、南京地铁S1号线和南京地铁S3号线的进出站口；南北两侧为公交上客区，东西两侧各设出租、社会车的上客区；广场南侧还有一个机场快客停靠带，可直接去禄口机场。
考虑到南北广场客流量的分布情况，公路客运南站设在南广场，占地5万平方米，市民在这里可实现铁路、公交、地铁、长途客车和机场大巴的“零距离”换乘。