运营线路
轨道交通1号线运营区间：莘庄—上海火车站—富锦路。长约37公里，共设28座车站，是一条纵贯上海南北走向的交通大动脉。线路识别色：红色。
轨道交通2号线运营区间：徐泾东—淞虹路—广兰路—浦东国际机场。长约68公里，共设30座车站，是一条横贯上海市区连接浦江两岸的东西向线路。广兰路以西(虹桥机场、市区方向)为8节编组，以东(浦东机场方向)为4节编组。从市区往川沙、浦东机场方向的乘客，在广兰路站下车后，到对面站台换乘4节编组列车。反之，从浦东机场去往市区、虹桥机场的旅客，在广兰路站下车后，到对面站台换乘8节编组列车。线路识别色：淡绿色。
轨道交通3号线运营区间：上海南站—长江南路—江杨北路。虹桥路站至宝山路站与4号线“共线营运。长约40.5公里，共设29座车站，是一条环绕中心城区以高架为主的地铁线路（地下站：铁力路；地面站：上海南站、江杨北路）。 线路识别色：黄色。
轨道交通4号线运营方式为环线，回库列车终点站宜山路。虹桥路站至宝山路站与3号线“共线营运”。长约33.6公里，共设26座车站，与轨道交通3号线接轨成环。线路识别色：紫色。
轨道交通5号线运营区间：闵行开发区－莘庄。长约17公里，共设11座车站（除莘庄为地面车站，其余10座为高架车站）。线路识别色：紫红色。
轨道交通6号线运营区间：港城路—巨峰路—高青路—东方体育中心。长约36公里，共设28座车站（其中高架车站8座，地下车站20座）。线路识别色：品红色。
轨道交通7号线运营区间：美兰湖—上海大学—花木路。长约37公里，共设32座车站。是上海轨道交通网络中一条南北向的骨干线。线路识别色：橘红色。
轨道交通8号线运营区间：市光路—东方体育中心—航天博物馆。长约41公里，共设29座车站。在人民广场与1、2号线形成大型轨交换乘枢纽，并且往航天博物馆方向的列车两边车门同时开启。线路识别色：蓝色。
轨道交通9号线运营区间：松江新城—杨高中路。长约46公里，共设23座车站，是上海轨道交通网络中重要的市域级骨干线路。线路识别色：淡蓝色。
轨道交通10号线运营区间：虹桥火车站－新江湾城（支线：航中路—新江湾城）。长约36公里，共设31座车站。线路识别色：淡紫色。
轨道交通11号线运营区间：嘉定北—江苏路（支线：安亭—江苏路）。全长约66.5公里，投入运营车站20座。线路识别色：深褐色。
在建线路
轨道交通11号线北段二期全部为地下线，是连接上海市西北地区～中心城～浦东新区的一条主干线。
北段二期全长约21公里，线路途经长宁区、徐汇区、浦东新区3个行政管辖区，共设13座地下车站，分别为交通大学（换乘10号线）、徐家汇（换乘1、9号线）、上海体育馆（换乘1、4号线）、龙华路（换乘12号线）、云锦路、石龙路（换乘3号线）、东方体育中心（换乘6、8号线）、三林、东明路、浦三路、严御路（预留）、御桥和罗山路（换乘16号线）。
轨道交通12号线工程为纵贯中心城区“西南——东北”轴向的重要主干线。
全长约为40公里，线路途经上海市的闵行区、徐汇区、黄浦区、静安区、闸北区、虹口区、杨浦区及浦东新区，共8个行政管辖区。共设32座车站，全部为地下站，分别是七莘路、虹莘路、顾戴路、东兰路、虹梅路、虹漕路、桂林公园、漕宝路（换乘1号线）、龙漕路（换乘3号线）、龙华路（换乘11号线）、船厂路（换乘7号线）、大木桥路（换乘4号线）、嘉善路（换乘9号线）、陕西南路（换乘1、10号线）、南京西路（换乘2、13号线）、汉中路（换乘1、13号线）、曲阜路(换乘8号线)、天潼路（换乘10号线）、国际客运中心、提篮桥、大连路（换乘4号线）、长阳路、宁国路、隆昌路、内江路、复兴岛、利津路、巨峰路（换乘6号线）、杨高北路、金京路、申江路和金海路。
轨道交通13号线一期工程为纵贯中心城区“西北——东南”轴向的重要主干线。
一期工程全长约为16公里，线路途经上海市嘉定区、普陀区、闸北区、静安4个行政管辖区。共设14座车站，全部为地下站，分别是华江路、金沙江西路、丰庄、祁连山南路、真北路、大渡河路、金沙江路（换乘3、4号线）、隆德路（换乘11号线）、武宁路、长寿路（换乘7号线）、江宁路、汉中路(换乘1、12号线)、自然博物馆、南京西路（换乘2、12号线）。
轨道交通16号线工程线路长约59公里，共设13座车站，分别为龙阳路站（换乘2、7号线、磁悬浮）、华夏西路站、罗山路站（换乘11号线）、周浦东站、鹤沙新城站、航头东站、新场站、野生动物园站、惠南站、浦东火车站站、临港新城北站、沪城环路站、临港新城站。线路走向为：浦东新区龙阳路站—沿罗山路、规划罗南大道（S3）—规划航三公路—人民西路—拱极路—穿川南奉公路、远东大道—折向平行浦东铁路东侧南行—跨越大治河—折向临港大道—终点临港新城站。
中期规划
只列出新建线、延伸线不列出，目前尚未确定具体走向，预计在2010-2020年间全部建设完成 上海轨道交通14号线
即原来的M6线，起讫点为环西二大道至金桥。
上海轨道交通15号线
即原来的轻轨L1线，15号线将作为市区轻轨线路贯穿上海中心城区南北，规划起讫点位于7号线合用的外环线锦秋路车辆段至紫竹科学园区。
上海轨道交通老16号线
即原来的轻轨L2线，一期起讫点为虹口足球场-上海动物园
上海轨道交通老17号线
即原来的轻轨L3线，一期起讫点为莘庄-宝山城市工业园
上海轨道交通18号线
即原来的轻轨L5线，起讫点为场北路-航头
上海轨道交通19号线
即原来的R4线崇明段，一期起讫点为申江路-长兴岛
上海磁悬浮机场线
站点为浦东机场站-龙阳路站-世博园站-上海南站-虹桥机场站
远期规划
（2020-2030）目前尚未确定具体走向，也无建设时间表
上海轨道交通5号线南延伸二期
从南桥新城站到海湾站
上海轨道交通老16号线二期
从上海动物园站到吴泾北站
上海轨道交通老17号线二期
从宝山工业园站到共青森林公园站
上海轨道交通19号线二期
从长兴岛站到崇明新城站，支线从长兴岛站到横沙岛站
上海磁悬浮机场线
南延伸从浦东国际机站场到临港新城站，向西可能会延伸至虹桥火车站，支线从龙阳路站到杭州东站