沪通铁路上海段有安亭、黄渡2个站点。
沪通铁路（沪通快铁）已敲定的有10个站，江苏境内分别是平东站、南通西站、张家港北站、张家港站、常熟站、太仓港站、太仓站、太仓南站等8个站，上海境内有安亭、黄渡2个站。这其中，由于沪通铁路与规划中的沿江城际铁路共用张家港至安亭部分，所以在常熟还为沿江城际预留了常熟东站。
沪通铁路（上海-南通），设计时速200公里，国铁Ⅰ级客货共线型快速铁路，可开行动车组。沪通铁路建成后与盐通铁路、连盐铁路、青连铁路形成无缝对接，成为青岛至上海的快速铁路通道。
沪通铁路自2008年2月立项至今，跨越长江工程方案一直是研究和论证的重点。2012年12月，该项目（南通至安亭段）工程可行性研究报告获国家发改委正式批复。2013年4月23日至28日，中国铁路总公司工程设计鉴定中心组织江苏和上海铁路部门的专家，沿规划新建的上海安亭至南通段铁路进行全线踏勘，从12个方面分组、分专业，对沪通铁路初步设计进行了审查。
沪通铁路建设可极大缩短上海与苏北地区的时空距离，有利于加强上海、苏北地区乃至北部沿海地区的辐射功能，对于实现江苏省政府制定的以沿江开发为突破口，实现沿江两岸产业联动发展，形成南北呼应，促进苏北经济发展，全面建设小康社会具有重要意义。同时，开辟了上海长江北岸大能力的运输通道，对于拓展上海市经济发展空间，促进长三角地区产业布局调整，实现区域资源共享具有积极意义。