将化合物格式SDF文件转换为CSV文件。
读取SDF中的属性并输出为CSV项目 不必使每个化合物的属性具有相同的属性（输出不为空的属性）。 import pandas as pdfrom rdkit import Chemimport argparsefrom collections import defaultdictdef main(): parser = argparse.ArgumentParser() parser.add_argument("-input", type=str, required=True) parser.add_argument("-output", type=str, required=True) parser.add_argument("-save_name", action='store_true', help="store header line as _Name") args = parser.parse_args() # Read SDF sdf_sup = Chem.SDMolSupplier(args.input) Props = [] if args.save_name: Props.append("_Name") for mol in sdf_sup: for name in mol.GetPropNames(): if name not in Props: Props.append(name) # dictionary for storing data param_dict = defaultdict(list) # Read