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数据挖掘课程设计r语言,如何进行数据挖掘

时间:2023-05-05 01:54:59 阅读:20183 作者:4656

1 .读取第三部分记忆数据(基因差异表达情况)。

RM(list=ls () ) #魔术操作,一键清除~

load(file='deg.Rdata ' ) ) ) ) ) ) ) ) )。

是头部(deg )

德格

2 .设置阈值计算基因上调和下调的数量

不同阈值筛选出的差异基因数量不同,后续超几何分布检测结果差异较大。

logFC_t=1.5

DEG$g=ifelse(DEG$p.value0.05,' stable ',

ifelse(deg$logfclogfc_t,' UP ',

ifelse(deg$logfc-logfc_t、' DOWN '、' stable ' )

设定为输出(#P0.05输出stable,其中,logFC大于1.5时输出上升输出(UP ),大于-1.5时输出下降输出(DOWN ),均不为) stable ),增加一列g,上升

表(deg $ g ) )。

提出上调41、下调88

头(de )

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