操作步骤
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进入工具
图2 显著性标记柱形图工具图标 差异分析工具分为两种,两组数据之间差异分析进入“显著性标记柱形图(两组)”;多组数据间两两进行差异分析进入“显著性标记柱形图(多组)”。 工具地址: https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/2_groups_sig 复制前往以上链接或点击 ,登录Omicshare云平台→“我的软件”→搜索“显著性标记柱形图”2
输入文件
点击图标进入后跳转至操作界面。界面包含 “数据输入”与“调整参数”两部分,其中需要输入的两个文件为txt格式,可以用excel表另存为txt格式。 图3 输入文件页面 输入两组数据: 输入的表格为差异检验表,第一列是不同样本的名称,之后每一行为该样本每个重复的数据,输入的样本为两组。但是要注意的是,每次至少要输入三次重复。 A288.93276.81527.85……B924.31746.8651.47…… 图4 输入两组数据的表格 输入多组数据: 与输入两组数据的格式相同,不同的是每次输入的多组样本。 A288.93276.81527.85......B924.31746.8651.47......C321.4351.64388.41...... 图5 输入多组数据的表格3
参数调整
通过参数调整可以对输出图形做简单修改: 统计检验 方法选择: 可以选择T检验或wilcoxon秩和检验。 输入图片的标题。 输入x轴和y轴的标题。 需要注意的是,每个标题必须是英文,要不然无法显示。 图6 作图相关参数4
输出结果
在Omicshare云平台提交任务后会输出结果压缩包,包含结果表格与柱形图两个部分内容。 结果表格 表头从左到右表示比较组、P值、显著性和分析方法。*代表显著性,ns代表组间无差异。 comparep.formatp.signifmethodA-vs-B0.023*T-test 图7 两组差异分析结果表格 comparep.formatp.signifmethodA-vs-B0.023*T-testA-vs-C0.722nsT-testB-vs-C0.025*T-test 图8 多组差异分析结果表格 输出图形 图9 显著性标识柱形图(两组) 图10 显著性标识柱形图(多组) 图形解读:横坐标为两个比较组名称,纵坐标为比较组数据的平均值。 *代表显著性,*代表p值小于0.05.**代表p值小于0.01,***代表p值小于0.001,以此类推。 Omicshare Tools 包含78个实用的小工具,一键操作,可以帮您快速、便捷的进行图形绘制和数据分析,会员还免费呢,快来Omicshare试试呀! 参考文献 [1] Ting Z , Pengbo X , Wenxiu W , et al. Arabidopsis G-Protein βSubunit AGB1 Interacts with BES1 to Regulate Brassinosteroid Signaling and CellElongation[J]. Frontiers in Plant Science, 2018, 8:2225. [2] 代资举, sxdhm, 个性的硬币, et al. 玉米雄穗分枝数主效QTL定位及qTBN5近等基因系构建[J]. 作物学报, 2018,v.44(08):27-35. 实用科研工具推荐详实生信软件教程分享
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