dotplot中提到的概念:E-value.表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。
E值的计算:(某处公式为MEAN/SD,应该是不对的,说不通)
E=K*m*n*(e-lambda*S)
其中,K和lambda与数据库和算法有关,是个常量;m代表目标序列的长度,n代表数据库的大小,S就是前面提到的S值。
引用:
http://blog.sciencenet.cn/blog-830496-676326.html
dotplot中提到的概念:E-value.表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。
E值的计算:(某处公式为MEAN/SD,应该是不对的,说不通)
E=K*m*n*(e-lambda*S)
其中,K和lambda与数据库和算法有关,是个常量;m代表目标序列的长度,n代表数据库的大小,S就是前面提到的S值。
引用:
http://blog.sciencenet.cn/blog-830496-676326.html
版权声明:该文观点仅代表作者本人。处理文章:请发送邮件至 三1五14八八95#扣扣.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。