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blast中的e值是5e,当blast检索的E值减少时

时间:2023-05-05 04:48:07 阅读:260465 作者:1199

dotplot中提到的概念:E-value.表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。

E值的计算:(某处公式为MEAN/SD,应该是不对的,说不通)

E=K*m*n*(e-lambda*S)

其中,K和lambda与数据库和算法有关,是个常量;m代表目标序列的长度,n代表数据库的大小,S就是前面提到的S值。

引用:
http://blog.sciencenet.cn/blog-830496-676326.html

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