RDKit 基于R基团分解Rgroup decomposition高亮分子

一组共享一个共同骨架的分子上做R基分解（RGD，R-group decomposition），为那些对准骨架的分子生成坐标，并生成分子图像，其中的R基团被涂上了颜色，使它们容易被挑选出来。

注：RDKit版本≥2020.09.1

 

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import rdkitfrom rdkit import Chemfrom rdkit.Chem import Drawfrom rdkit.Chem.Draw import IPythonConsoleIPythonConsole.molSize=(450,350)from rdkit.Chem import rdRGroupDecompositionfrom rdkit.Chem import rdqueriesfrom rdkit.Chem import rdDepictorfrom rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2Dfrom rdkit import GeometryrdDepictor.SetPreferCoordGen(True)import pandas as pdfrom IPython.display import SVG,Imagefrom ipywidgets import interactprint(rdkit.__version__) 2020.09.1