RDKit中处理分子Mol对象
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from rdkit import rdBase, Chemfrom rdkit.Chem import AllChem, Drawprint('rdkit version: {}'.format(rdBase.rdkitVersion))载入数据
suppl = Chem.SDMolSupplier('sdf_20191011152835.sdf')mols = [x for x in suppl if x is not None]len(mols) Mol对象的组成由于Mol对象是分子,因此它们是由原子组成的。分子是通过原子间键的形成而形成的。RDKit的Mol对象准备了Atom对象和Bond对象。
Atom和Bond对象相互链接,
绑定Atom对象形式的 哪些原子在键对象中形成键