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报告基因内参基因,上游基因与下游基因标准

时间:2023-12-30 20:00:02 阅读:811 作者:一句成真

报告基因

定义

报告基因(reporter gene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控,筛选得到转化体。

特征

作为报告基因,在遗传选择和筛选检测方面必须具有以下几个条件:

(1)已被克隆和全序列已测定;

(2)表达产物在受体细胞中本不存在,即无背景,在被转染的细胞中无相似的内源性表达产物;

(3)其表达产物能进行定量测定。

应用

在植物基因工程研究领域,已使用的报告基因有以下几种:胭脂碱合成酶基因(nos)、章鱼碱合成酶基因(ocs)、新霉素磷酸转移酶基因(nptⅡ)、氯霉素乙酰转移酶基因(cat)、庆大霉素转移酶基因、葡萄糖苷酶基因、荧光酶基因等。nos、ocs这两个基因是致瘤土壤农杆菌(Agrobacterium tumfaciens)的Ti质粒特有的,对Ti质粒进行改造,用相应的致瘤农杆菌转化植物体时,如果外源基因转入植物体中,则这两种报告基因在植物根茎叶中均能表达,不受发育调控,检测时直接用转化体提取液进行纸电泳,染色后在紫外光下观察荧光即可。nptⅡ、cat及庆大霉素转移酶基因,均为抗生素筛选基因,相关的酶可以对底物进行修饰(磷酸化、乙酰化等),从而使这些抗生素失去对植物生长的抑制作用,使得含有这些抗性基因的转化体能在含这些抗生素的筛选培养基上正常生长,也可以用转化体提取液体,外用同位素标记,放射自显影筛选转化体。

目前常用的一种报告基因是β-D-葡萄糖苷酶基因,该酶催化底物形成β-D-葡萄糖苷酸,它在植物体中几乎无背景,组织化学检测很稳定,可用分光光谱、荧光等进行检测。荧光酶基因(luc)是1985年从北美荧火虫和叩头虫cDNA文库中克隆出来的,该酶在有ATP、Mg2+、O2和荧光素存在下发出荧光,这样就可用转基因植物整株或部分直接用X-光片或专门仪器进行检测。

在动物基因表达调控的研究中,报告基因也被广泛应用。常用的有氯霉素乙酰转移酶基因(cat)、β-半乳糖苷酶基因(LacZ)<X-gal作为底物,蓝色菌落>、二氢叶酸还原酶基因、荧光酶基因等。cat 基因作为报告基因,检测时可通过放射自显影观察。荧光酶基因作为报告基因,具有检测速度快、灵敏度比cat基因高30~1000倍、费用低、不需使用放射性同位素等

优点,得到了广泛的采用。

此外,在反式作用因子相互作用的检测方式枣酵母双杂交体系中,可通过报告基

因的表达,研究蛋白质与蛋白质之间的相互作用。双杂交体系是由报告基因转录调控区、报告基因及一对可以相互作用的杂合反式作用因子组成。近年来从上述杂交体系中发展出的单一杂交体系技术,也是根据报告基因表达量的检测筛选出与已知顺式作用元件相结合的未知因子的DNA,该项技术正广泛应用于克隆细胞中含量微弱且用生化手段难以纯化的反式作用因子。

gus基因

gus基因就是转β-葡糖醛酸酶基因

该基因产物为GUS 蛋白质,相当稳定而不易降解,并为一水解酵素,有简易的测定方法;且可使用市售的基质(substrate) 在原位(in situ) 显现出酵素的活性,以肉眼即可检测其产物,非常方便。

gus基因存在于E.coli等一些细菌基因组内,编码β-葡萄糖苷酸酶。β-葡萄糖苷酸酶是一个水解酶,以β-葡萄糖苷酸酯类物质为底物,其反应产物可用多种方法检测出来。由于绝大多数植物没有检测到葡萄糖苷酸酶的背景活性,因此这个基因被广泛应用于基因调控的研究中。根据地gus基因检测所用的底物不同,可以选择三种检测方法:组织化学法、分光光度法和荧光法(灵感度为分光光度检测法最高),其中最为常用的是组织化学法。

组织化学法检测以5-溴-4-氯-3-吲哚-β-葡萄糖苷酸酯(X-Gluc)作为反应底物。将被检材料用含有底物的缓冲液浸泡,若组织细胞发生了解gus基因的转化,并表达出Gus,在适宜的条件下,该酶就可将X-Gluc水解生成蓝色产物,这是由其初始产物经氧化二聚作用于形成的靛蓝染料,它使具Gus活性的部位或位点呈现蓝色,用肉眼或在显微镜下可看到,且在一定程度下根据染色深浅可反映出Gus活性。因此利用该方法可观察到外源基因在特定器官、组织,甚至单个细胞内的表达情况。

GUS作为报告基因的优缺点

采用报告基因是gus基因,它具有以下一些优点:

①利用一个简单的组织化学检测就可以精确地分析gus融合基因的时空表达模式。

②GUS蛋白在转化植物细胞中稳定存在,它对较高的温度及去污剂有一定的耐受性。

③检测方法简单,可以进行定性和定量检测。以X-Gluc为底物,通过显色反应可直接观察组织器官中gus 基因的活性;以4-MUG为底物,GUS蛋白可以催化其水解为4-MU和β-D葡萄糖醛酸,4-MU分子中的羟基解离后被365nm的光激发,产生455nm荧光,可用荧光分光光度计定量检测。

④在大多数植物组织中GUS活性的本底低;

⑤检测时只需少量植物组织。

但是,在实验过程中也发现其存在一些不足:

①染色不均匀。通常在伤口处较深。对材料进行抽真空处理可以提高GUS染液的渗透能力,但是不能从根本上解决这一问题;实验中发现对需进行染色的材料进行徒手切片,再进行染色会使染色效果得到改善。

②不能进行活体染色。组织化学染色后愈伤失去继续培养的可能,在检测茎杆和叶鞘时会对材料造成很大的伤害及损失。

③不能进行亚细胞定位。如需要进行亚细胞定位,可用gfp作为报告基因。

报告基因内参基因,上游基因与下游基因标准-第1张

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报告基因内参基因,上游基因与下游基因标准-第4张

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