林保怡根据目前所知道的情况来看他是未婚（当然不排除未公开秘密结婚），没有任何结婚的新闻，以及消息。而且近几年林保怡的性取向一直都是个谜，有传闻出柜，包养助手，带男友见家人，着实让粉丝们捏了一把汗。
林保怡入行以来感情生活都非常神秘，2004年突然自爆有圈外女友，不过他口中的"幽灵女友"从未现过身。2007年林保怡丧母，港男彭冠期出席丧礼戴孝，令二人的超友谊关系曝光。未几彭冠期被同志片导演云翔硬撬，林保怡不再和艺人交心，自此与男助手出双入对。
2012年2月，林保怡与一名同性密友冲上的士，密友护男心切，帮林保怡遮挡镜头。3月14日下午他与貌似刘浩龙的大块头嫩男先到铜锣湾吃米线，再一起返回马鞍山寓所。年届46岁的林保怡，一直没有表明性取向，除甚少谈及个人感情生活外，平日生活作风亦十分低调。直至2007年林保怡丧母，港男彭冠期不止出现丧礼，还戴孝招待亲友，令林保怡这段秘密友谊见光。事后林保怡没有公开回应，不久彭冠期与同志片导演云翔在一起，有传林保怡因此心情低落。