上海虹桥站站内实现了与飞机、上海公交、上海长途客车、上海地铁的零换乘。
1、前往上海虹桥国际机场T1航站楼：可乘坐上海地铁10号线由虹桥火车站站至虹桥1号航站楼站。
2、前往上海虹桥国际机场T2航站楼：上海虹桥站与虹桥机场T2航站楼紧紧相连，旅客出火车站后可沿地下通道的导向标识，步行约10分钟就可以到达2号航站楼。
3、前往浦东国际机场：可乘坐上海地铁2号线，并于22点前在广兰路站前往对面站台换乘上海地铁2号线4节编组列车前往浦东国际机场，全程约耗时1.5小时；或乘坐上海地铁2号线至龙阳路站换乘磁悬浮列车，全程可控制在1小时内。
4、前往上海火车站：乘坐上海地铁10号线至虹桥路站换乘上海地铁3号线或上海地铁4号线到达上海火车站站，或乘坐上海地铁2号线至中山公园站换乘上海地铁3号线或上海地铁4号线亦可到达上海火车站站，或乘坐上海地铁2号线至人民广场换乘上海地铁1号线也可到达；上海941路（06:00~23:00），虹桥机场2号航站楼虹桥机场―上海火车站南广场，单程运行约1小时。
5、前往上海南站：乘坐上海地铁2号线至人民广场站换乘上海地铁1号线可到上海南站，或乘坐上海地铁2号线至中山公园站换乘上海地铁3号线亦可到达上海南站，或乘坐上海地铁10号线至虹桥路换乘上海地铁3号线也可到到达。
6、长途客运：虹桥枢纽东交通中心位于上海虹桥站西侧，初期开行长途汽车班次200余班，集中发往江苏和安徽省各区县。