基于Python和RDKit对化合物数据进行预处理。
环境
MolVS是专门用于化合物预处理的库。
rdkit 2020.03 molvs 0.1.1化合物(Compound)预处理 RDKit:SanitizeMol
Kekure的形成,化合价的确认,芳香性的设定,结合等。
参考:http://rdkit.org/docs/source/rdkit.Chem.rdmolops.html
MolVS : Normarize
参考:https://molvs.readthedocs.io/en/latest/guide/standardize.html
进行了一系列转换,以修复常见错误并标准化特征组。
from rdkit import